潜艇在二战风云2中使用起来具有一定难度，其操作和战术运用与其他舰船兵种存在显著差异，对玩家的战场意识、时机把握和资源管理能力提出了更高要求。这种难度首先体现在其独特的操作机制上，潜艇拥有下潜和上浮的技能，深潜状态下可以获得隐身效果，但相应地移动速度会降低，并且长时间潜航会消耗有限的氧气，需要定期上浮补充空气。潜艇攻击时会暴露自身位置，鱼雷的装填时间也较长，这意味着每次攻击后都需要规划撤离路线，操作不当极易陷入被动。掌握潜艇并非仅仅会点击攻击指令那么简单，而是需要理解并熟练运用其独有的生存与攻击循环。
潜艇的操作难度根植于其核心战术定位是伏击和突袭，而非正面作战。这就要求玩家能预判敌方舰队的行进路线，提前在关键航线上进行埋伏。成功的伏击依赖于对深潜隐身状态的运用及对攻击时机的精准把握，必须等待目标进入有效射程后方可发动攻击，以求一击致命。整个战术执行过程充满风险，一旦过早暴露或攻击后未能及时撤离，防御能力薄弱的潜艇很容易被反击火力消灭。这种打法对玩家的耐心和战场局势判断力是极大的考验。
潜艇的运用还非常依赖玩家对敌我兵种克制的深刻理解，这进一步增加了其使用门槛。驱逐舰被普遍认为是潜艇的天敌，因为它们装备了声呐或主动探测技能，能够有效发现处于潜航状态的潜艇。在作战中，如何利用地形掩护规避驱逐舰的巡逻范围，或是在发现敌方驱逐舰时选择绕行、撤退或呼叫队友支援，是玩家必须面对的核心课题。潜艇虽然对大型水面舰艇如战列舰和航母能造成巨大威胁，但面对拥有反潜能力的单位时则非常脆弱，这种极端的优劣势对比要求玩家在行动时必须保持高度警惕和清晰的战术思路。
潜艇在团队中的协同作战也对玩家的配合意识提出了要求。它通常不适合单独深入敌方控制区域行动。在团队作战中，潜艇可以承担侦察任务，利用其隐蔽性为队友标记敌方舰队位置，引导远程火力打击；也可以与己方驱逐舰等水面舰艇配合，形成反潜与突袭相结合的战术组合。如果能组织多艘潜艇协同作战，实施类似历史上狼群的战术集中伏击同一目标，将能显著提高攻击效率。如何与队友沟通、协调行动，是发挥潜艇团队价值的关键。
潜艇在前中期的获取和投入本身就需要一定的规划，这也构成了其使用难度的前置条件。要获得如拔鱼级这类潜艇，通常需要先将海军基地和兵工厂等建筑提升到相应等级。潜艇的建造和后续升级需要消耗大量的特定资源，例如石油和钢铁，并且其维护成本也相对较高，战损后需要及时修理。这意味着玩家在资源分配和科技研发路线上需要有所侧重，优先确保潜艇部队的成型和战斗力维持，否则将难以在战场上形成有效战力。
它要求玩家具备良好的战场全局观，能够耐心埋伏并果断出击，同时深刻理解敌我克制关系，并做好精细的资源与状态管理。尽管操作复杂且对意识要求高，但一旦掌握其精髓，潜艇便能成为海战中扭转战局的关键奇兵，通过有效的伏击和突袭对敌方舰队造成重大威胁。
